В геноме аденоассоциированных вирусов белки капсида кодируются перекрывающимися нуклеотидными последовательностями. При этом, транскрипция начинается с одного промотора, p40, но полученная мРНК в ходе альтернативного сплайсинга затем может созревать с образованием двух разных продуктов, один из которых на несколько аминокислотных остатков короче другого. При этом трансляция начинается со второго начального кодона в последовательности пре–мРНК.
На схеме ниже представлен образец подобной последовательности ДНК. При решении задачи учитывайте, что что комплементарные цепи нуклеиновых кислот антипараллельны (5’ концу в одной цепи соответствует 3’ конец другой цепи). Синтез нуклеиновых кислот начинается с 5’ конца. Рибосома движется по иРНК в направлении от 5’ к 3’ концу.
5’–ГАТГТТЦАГГЦТААТГААТАГАГГАТААГ–3’
3’–ЦТАЦААГТЦЦГАТТАЦТТАТЦТЦЦТАТТЦ–5’
Определите, какая из цепей является кодирующей, а какая − транскрибируемой. Запишите последовательность нуклеотидов мРНК и аминокислотных состав двух альтернативных белковых продуктов. Объясните последовательность решения задачи. Для выполнения задания используйте таблицу генетического кода. При написании последовательностей нуклеиновых кислот указывайте направление цепи.
| Первое основание | Второе основание | Третье основание | |||
| У | Ц | А | Г | ||
| У |
Фен Фен Лей Лей |
Сер Сер Сер Сер |
Тир Тир — — |
Цис Цис — Три |
У Ц А Г |
| Ц |
Лей Лей Лей Лей |
Про Про Про Про |
Гис Гис Глн Глн |
Арг Арг Арг Арг |
У Ц А Г |
| А |
Иле Иле Иле Мет |
Тре Тре Тре Тре |
Асн Асн Лиз Лиз |
Сер Сер Арг Арг |
У Ц А Г |
| Г |
Вал Вал Вал Вал |
Ала Ала Ала Ала |
Асп Асп Глу Глу |
Гли Гли Гли Гли |
У Ц А Г |
