У бактерий есть специфические транспортно-матричные РНК (тмРНК). В них есть шпилечная структура, образованная комплементарными участками РНК. После шпильки через несколько нуклеотидов находится открытая рамка считывания, которая начинается с кодона, кодирующего аминокислоту Глу. Фрагмент молекулы ДНК имеет следующую последовательность нуклеотидов:
5’−ТЦГААТЦГТАГЦГЦГАТТЦААГАГЦТАТГГЦАТТЦ−3’
3’−АГЦТТАГЦАТЦГЦГЦТААГТТЦТЦГАТАЦЦГТААГ−5’
Нижняя цепь ДНК является матричной. Найдите участок тмРНК, установите вторичную структуру тмРНК, найдите комплементарные участки в ней, определите начало открытой рамки считывания, последовательность аминокислот в полипептице. Для решения задания используйте таблицу генетического кода.
| Первое основание | Второе основание | Третье основание | |||
| У | Ц | А | Г | ||
| У |
Фен Фен Лей Лей |
Сер Сер Сер Сер |
Тир Тир — — |
Цис Цис — Три |
У Ц А Г |
| Ц |
Лей Лей Лей Лей |
Про Про Про Про |
Гис Гис Глн Глн |
Арг Арг Арг Арг |
У Ц А Г |
| А |
Иле Иле Иле Мет |
Тре Тре Тре Тре |
Асн Асн Лиз Лиз |
Сер Сер Арг Арг |
У Ц А Г |
| Г |
Вал Вал Вал Вал |
Ала Ала Ала Ала |
Асп Асп Глу Глу |
Гли Гли Гли Гли |
У Ц А Г |
Схема решения задачи включает:
1) последовательность тмРНК:
5’−УЦГААУЦГУАГЦГЦГАУУЦААГАГЦУАУГГЦАУУЦ−З’;
2) вторичная структура:
3) аминокислоте глу соответствуют кодоны иРНК: 5’−ГАА−З’ или 5’−ГАГ−3’;
4) открытая рамка считывания начинается с кодона 5’−ГАГ−3’;
5) начало открытой рамки считывания: 5’−ГАГЦУАУГГЦАУУЦ−З'
6) фрагмент полипептида: глу-лей-три-гис.
